禽流感病毒与人流感病毒的比较揭示了病毒基因组的突变偏向

在过去的几年里，针对包括1918年大流感株在内的数千种流感A病毒株的基因组序列数据，以及数百个引发越来越多的人类死亡案例的禽流感病毒H5N1的分离株，已经公开发布。这大量的序列数据使我们能够进行人类和禽类病毒的比较基因组学。我们发现感染这两种宿主的流感A病毒的核苷酸组成有足够大的差异，使我们几乎能以100%的准确率确定宿主。这种分配在片段级别上有效，这使我们能够构建每个株内单个片段的重组历史。我们提出不同的核苷酸组成可以通过宿主依赖的突变偏向来解释。为支持这一观点，我们估算了不同聚合酶片段的定植率以及同义变更与非同义变更的比率。此外，我们提供证据支持H1N1流感病毒在1918年爆发前刚刚进入人群的假设，最早的时间界限为1910年。