具有互补环的RNA发夹之间的弯曲螺旋结构

ColE1质粒特异性转录本RNA I和RNA II之间的初始相互作用，作为质粒复制的反义调节因子，形成一个瞬态复合物，该复合物由RNA二级结构中的互补环组成。采用多维异核磁共振光谱法表征具有七个核苷酸互补环的模型RNA发夹之间形成的复合物。环-环螺旋中形成七个碱基对，环残基在其螺旋茎的3'端连续堆叠。通过凝胶电泳记录的环-环螺旋中的锐角弯曲缩小了主要沟，允许磷酸二酯主链跨越主要沟连接，以便在其5'-端闭合发夹环。罗姆蛋白的结合进一步增强了该弯曲，罗姆是一个调节复制的ColE1编码蛋白。