潜伏生长转化病毒感染中转录的mRNA的核苷酸序列表明它可能编码一个膜蛋白

在通过病毒进行体外生长转化建立的潜伏感染细胞系IB4中，最丰富的EB病毒mRNA是一个2.8千碱基的RNA，由基因组右端附近大部分独特的DNA编码。RNA是从右到左转录的，并且剪接掉了两个内含子。该基因组区域经过测序，RNA的外显子通过DNA-RNA杂交的S1分析和引物扩增进行了鉴定。RNA中的第一个起始密码子距离其5'端40个核苷酸。 从起始密码子开始，有一个1158核苷酸的开放阅读框，其中穿过了两个内含子。翻译蛋白的重要特征如下：(i) 氨基末端高度带电，不像是领导序列；(ii) 有六个明显疏水的α螺旋结构域，每个含有21个氨基酸，并通过5到7个氨基酸段连接，预测为反转弯；(iii)羧基末端的200个氨基酸明显酸性，含有6个谷氨酸和37个天冬氨酸。预测疏水区域形成六个膜穿透区，短带电的氨基末端和长酸性的羧基末端在膜的内部。该蛋白可能负责在EB病毒转化细胞的质膜中检测到的新抗原，淋巴细胞确定膜抗原。RNA中还有两个其他开放阅读框。