MtArt：节肢动物氨基酸替换的新模型

本研究采用统计学方法，筛选出在后生动物不同分类阶元上最适合各个线粒体（mt）蛋白的模型。结果发现，除 Nd6 外，现有的线粒体替换矩阵 MtREV 和 MtMam 是不同分类阶元下脊椎动物 mt 蛋白的最优拟合模型。值得注意的是，现有的线粒体矩阵普遍无法最优拟合无脊椎动物的 mt 蛋白。为了更好地模拟无脊椎动物 mt 蛋白的演化，基于节肢动物 mt 蛋白质组构建了一种名为 MtArt 的新替换矩阵。研究发现，该新模型最适合几乎所有已分析的无脊椎动物 mt 蛋白数据集。在不同数据集中观察到的模型拟合模式表明，没有任何单一的替换矩阵能够描述 mt 蛋白的普遍演化特征，相反，分类学偏差和/或不同 mt 遗传密码的存在对所选模型有着重大影响。