Sanger Tree of Life HMW DNA-Extraktion: Modifiziertes Omega Bio-Tek E.Z.N.A.® v1

Dieses Protokoll beschreibt die manuelle Extraktion und SPRI von HMW-DNA aus frisch gefrorenen Quallenproben, die für das Long-Read-Sequencing vorgesehen sind, unter Verwendung einer Kombination aus dem Omega Bio-Tek E.Z.N.A.® Molluskenprotokoll. Es wurde hauptsächlich vom Protokoll des Omega Bio-Tek E.Z.N.A.® Mollusken- & Insekten-DNA-Kits abgeleitet, indem die initiale Lyse und Fällung (Schritte 1 bis 10) mit reduzierten Inkubationstemperaturen, dem Weglassen des Vortexens und der Zugabe einer bead-basierten Extraktion mit Sera-Mag™ SpeedBeads kombiniert wurden, wie sie im Sanger Tree of Life HMW DNA Extraction: Automatisierte Pflanzenorganische HMW gDNA-Extraktion (POE) Protokoll verwendet wird. Akronyme: HMW: hohe Molekulargewichte, LI: niedrige Eingabe, ULI: ultra-niedrige Eingabe.