July 18, 2023Open Access

MitoHiFi: eine Python-Pipeline zur Assemblierung mitochondrialer Genome aus PacBio Hochpräzisionsdaten

MUMarcela Uliano‐SilvaNord University JFJoão Gabriel R. N. FerreiraDeoxi Biotecnologia (Brazil)KKKsenia KrasheninnikovaWellcome Sanger Institute

Key Points

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Abstract

MitoHiFi ist in der Lage, mitochondriale Genome aus einer breiten phylogenetischen Reihe von Taxa aus Pacbio HiFi-Daten zusammenzustellen. MitoHiFi ist in Python geschrieben und steht kostenlos auf GitHub zur Verfügung ( https://github.com/marcelauliano/MitoHiFi ). MitoHiFi ist mit seinen Abhängigkeiten als Docker-Container auf GitHub erhältlich (ghcr.io/marcelauliano/mitohifi:master).

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