Das Genom-Portal des Joint Genome Institute des Energieministeriums

Das Joint Genome Institute (JGI) des Energieministeriums (DOE) ist eine nationale Benutzereinrichtung mit umfangreichen DNA-Sequenzierungs- und Analysefähigkeiten, die darauf abzielt, die Genomik für bioenergetische und umwelttechnische Anwendungen voranzutreiben. Neben der jährlichen Erzeugung von Billionen von DNA-Basen entwickelt und pflegt das Institut Datenmanagementsysteme und spezialisierte analytische Fähigkeiten, um komplexe genomische Datensätze zu verwalten und zu interpretieren, und um einer wachsenden Nutzergemeinschaft auf der ganzen Welt die Analyse dieser Daten in unterschiedlichen Kontexten über das Web zu ermöglichen. Das JGI Genome Portal (http://genome.jgi.doe.gov) bietet einen einheitlichen Zugangspunkt zu allen JGI-genomischen Datenbanken und Analysetools. Ein Benutzer kann alle DOE JGI Sequenzierungsprojekte und deren Status finden, nach Assemblierungen und Annotationen sequenzierter Genome suchen und diese herunterladen sowie die Genome interaktiv erkunden und mit anderen sequenzierten Mikroben, Pilzen, Pflanzen oder Metagenomen unter Verwendung spezialisierter Systeme vergleichen, die auf jede bestimmte Klasse von Organismen zugeschnitten sind. Hier beschreiben wir die allgemeine Organisation des Genome Portals und die neueste Ergänzung, MycoCosm (http://jgi.doe.gov/fungi), eine neue integrierte Ressource für die Pilzgenomik.