Classificação não invasiva de subtipos de câncer de pulmão usando assinaturas derivadas de tumores e metiloma de cfDNA

Um diagnóstico preciso de câncer de pulmão é importante para a tomada de decisões sobre o tratamento. A biópsia de tumor e o exame histológico são o padrão para determinar os subtipos histológicos de câncer de pulmão. A biópsia líquida, particularmente o DNA livre de células (cfDNA), mostrou resultados promissores recentemente na detecção e classificação do câncer. Neste estudo, investigamos o potencial do metiloma de cfDNA para a classificação não invasiva de subtipos histológicos de câncer de pulmão. Focamos nos dois subtipos de câncer de pulmão mais prevalentes, adenocarcinoma pulmonar e carcinoma de células escamosas do pulmão. Usando uma abordagem de descoberta de marcadores baseada em fragmentos, identificamos marcadores de metilação robustos e específicos para subtipos a partir de amostras tumorais. Esses marcadores foram validados com sucesso em coortes independentes e associados à atividade transcricional específica do subtipo. Aproveitando esses marcadores, construímos um modelo de classificação de subtipos usando perfis de metilação de cfDNA, alcançando uma AUC de 0,808 na validação cruzada e uma AUC de 0,747 na validação independente. Alterações no número de cópias do tumor inferidas da análise do metiloma de cfDNA revelaram potencial para seleção de tratamento. Em resumo, nosso estudo demonstra o potencial da análise do metiloma de cfDNA para a subtipagem não invasiva de câncer de pulmão, oferecendo insights para monitoramento e detecção precoce do câncer.