포도나무(Vitis vinifera)에서 전사인자 WRKY의 게놈 전반적 식별, 특성화 및 진화: 새로운 관점 및 업데이트

WRKY는 식물에 특화된 다유전형 전사인자 가족으로, 식물 발달 및 다양한 스트레스 반응 과정의 조절에 관여합니다. 그러나 WRKY 유전자의 진화는 완전히 이해되지 않았습니다. 이 가족은 포도나무에서 불완전하게 연구되었으며, 다양한 연구에서 WRKY 유전자가 서로 다른 숫자로 명명되어 큰 혼란을 초래했습니다. 본 연구에서는 서로 다른 품종의 여섯 가지 게놈을 바탕으로 62개의 Vitis vinifera WRKY 유전자를 식별했습니다. 모든 WRKY 유전자는 염색체 위치에 따라 번호가 매겨졌으며, 번호 매겨진 것의 완전한 수정이 수행되었습니다. 서로 다른 품종 간의 아미노산 변동성이 처음으로 평가되었고, 일부 WRKY의 경우 5%를 초과했습니다. 유전자 구조에 따라, 모든 WRKY는 두 그룹으로 나눌 수 있었습니다: 더 많은 엑손/긴 길이와 적은 엑손/짧은 길이. 처음으로 일부 키메라 WRKY 유전자가 포도나무에서 발견되었으며, 이는 다양한 과정의 조절에서 특정 역할을 할 수 있습니다: VvWRKY17(비세포질 도메인 뒤에 N-말단 신호 펩타이드 영역이 있음)과 VvWRKY61(Frigida 유사 도메인). 다섯 개의 계통 발생 군 A–E가 밝혀졌고, WRKY 그룹(I, II, III)과 상관관계가 있었습니다. WRKY의 진화가 연구되었으며, WRKY의 진화에 있어 복잡성과 단순화의 두 가지 동적 단계가 있는 WRKY 진화 모델을 제안했습니다.