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Résumé Cette revue examine minutieusement la dynamique des microbiomes des rivières, en mettant l'accent sur les rivières Gange et Yamuna d'Asie du Sud. Ces rivières sont vitales pour les paysages écologiques et culturels et offrent une compréhension de l'interaction entre les facteurs écologiques et anthropiques et leur impact sur les communautés microbiennes et leurs activités. Des facteurs écologiques et hydrologiques tels que les changements saisonniers, le débit de l'eau et les propriétés physico-chimiques des rivières influencent la diversité et l'abondance microbiennes. L'effet des métaux lourds provenant de sources industrielles et agricoles sur le microbiome des rivières et la manière dont ces polluants modifient les structures des communautés microbiennes et la santé des écosystèmes ne sont pas encore bien compris. Cela souligne la nécessité de traitements d'eau durables et de remédiations pour des solutions d'ingénierie pratiques. L'étude révèle comment ces interactions, qu'elles soient symbiotiques ou compétitives, affectent la composition et la fonctionnalité des communautés microbiennes riveraines. Un aspect innovant de notre recherche est le potentiel des microbiomes des rivières en tant qu'indicateurs de la contamination par les eaux usées urbaines. Nous démontrons comment les schémas microbiens peuvent signaler les niveaux de pollution, s'avérant précieux pour le suivi, la gestion et l'atténuation environnementale. Une attention particulière a été accordée au rôle des microbes dans les cycles biogéochimiques des écosystèmes fluviaux, sur la manière dont ces microbes contribuent au recyclage des nutriments, à la décomposition de la matière organique et à la productivité globale de l'écosystème, soulignant leur rôle crucial dans le maintien de la valeur esthétique de la rivière. De plus, l'étude évalue les dernières méthodologies pour analyser les données métagénomiques des microbiomes, y compris l'annotation fonctionnelle et les techniques d'analyse des communautés microbiennes. Les résultats mettent en évidence l'importance clé de comprendre les microbiomes des rivières pour les chercheurs en hydrologie, écologie et microbiologie.
Chaturvedi et al. (Mer,) ont étudié cette question.
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