Nueva firma de reparación del daño del ADN para la inmunoterapia y un esquema propuesto de subtipado molecular en el cáncer gástrico

Resumen Los mecanismos de reparación del daño del ADN (DDR) están estrechamente relacionados con la aparición y progresión de las células cancerosas. La diversidad y complejidad de los mecanismos de reparación del ADN también afectan el microambiente inmunológico tumoral. En este estudio, analizamos datos relacionados con genes del cáncer gástrico para seleccionar 19 genes DDR asociados con el pronóstico. A través del análisis de regresión Cox multivariada y LASSO, obtuvimos un modelo pronóstico para el cáncer gástrico basado en dos genes (CHAF1A, PER1) y lo validamos mediante qPCR con 30 pares de muestras de GC. Además, se identificaron compuestos de pequeñas moléculas que apuntan a los efectos antitumorales de los genes predictivos a través de acoplamiento molecular. Basándonos en este modelo, comparamos las características inmunitarias de los dos grupos de pacientes y las diferencias en el microambiente inmunológico tumoral (TME), y además predijimos el resultado y pronóstico de la inmunoterapia. Adicionalmente, utilizamos métodos de agrupamiento consensuado y k-means para identificar aún más subtipos moleculares de los pacientes, y comparamos las características inmunitarias de los dos subtipos DDR y predijimos la sensibilidad a fármacos de los dos subtipos de pacientes a fármacos de quimioterapia clínica estándar.