选择性剪接（AS）是调控转录组多样性和细胞特性的基本机制。尽管 293T（人胚肾）和 A549（人肺腺癌）细胞系被广泛使用，但细胞类型特异性的剪接动力学（包括对受体过表达的反应）仍未得到充分阐明。为了解决这一问题，我们将 Oxford Nanopore 长读长测序与 BGI 短读长数据相结合，分析了基础状态及 GPCR 过表达条件下（293T 中的 ADORA3；A549 中的 P2RY12）的转录组。使用 FLAIR 和 SQANTI3 进行的全长异构体分析揭示了广泛的转录组复杂性，包括 293T 细胞中 18.02% 的新异构体和 A549 细胞中 19.52% 的新异构体。我们发现，293T 细胞表现出富集于剪接相关通路的稳定转录组架构，而 A549 细胞则经历了与肿瘤发生过程相关的更广泛的转录重塑。这些发现表明，293T 细胞可能是研究剪接调控的合适模型，而 A549 细胞可作为探索肿瘤相关转录组动力学的相关系统。我们的工作阐明了背景依赖性的 AS 调控，并强调了将长读长测序与 FLAIR/SQANTI3 相结合以剖析细胞状态特异性转录组动力学的价值。
Li et al. (Sat,) 研究了这一问题。