摘要 背景 越来越多的证据表明,在疑似脓毒症的处理中广泛存在广谱抗生素过度使用的情况,并会导致危害。临床医生缺乏及时的诊断工具来指导何时需要使用广泛的经验性革兰氏阴性菌(GN)覆盖。为了弥补这一空白,我们旨在确定GN感染的宿主生物标志物特征,作为未来开发快速诊断检测的概念验证。表1. 分类发现/交叉验证数据集中受试者和病原体特征 a. “全身性感染”是指没有原发解剖感染部位的过程,如登革热,但不包括菌血症并发原发感染部位的病例。 b. 表现为疑似脓毒症并符合入组标准,但最终被判定为确诊非感染性疾病的受试者,例如充血性心力衰竭或糖尿病酮症酸中毒。 c. 均为 Mycobacterium tuberculosis 引起的疾病病例。 d. 其他病原体包括 Streptococcal spp. (n=5)、Staphylococcus aureus (n=4)、Mycobacterium tuberculosis (n=4)、登革热病毒 (n=2) 等其他病原体。交叉验证中革兰氏阴性菌感染的宿主转录组和蛋白质特征表现 基于分层5折交叉验证(重复5次),革兰氏阴性菌特征与判定诊断相比的受试者工作特征曲线下面积。 方法 本分析使用了由 Austere environments Consortium for Enhanced Sepsis Outcomes (ACESO) 开展的脓毒症纵向研究中受试者入组时采集的血液衍生的 RNASeq 和 29 种分析物蛋白质组学数据集。原始研究中的入组标准基于 sepsis-2 定义。纳入了来自加纳库马西和柬埔寨茶胶省研究中心且具有经独立判定的确诊诊断的受试者。该数据集被分类为经实验室确诊的GN感染受试者和经确诊为任何其他非GN诊断的受试者。我们进行了经错误发现率校正的 t 检验,随后使用逻辑回归通过分层5折交叉验证(重复5次)对转录本和蛋白质组合进行了详尽搜索。 结果 发现/交叉验证数据集包括 31 例GN感染和 37 例其他病例。转录组学详尽搜索得出了一个以 SMARCD3、EIF4G1 和 IER5 为特征的标志物组合,其受试者工作特征曲线下面积(AUROC)为 0.891。基于蛋白质的标志物特征(特征包括:IL17A、IL1RA 和 MMP8)的 AUROC 为 0.795。 结论 这一探索性分析中使用的方法展示了在等待基于培养的诊断结果期间开发用于指导脓毒症经验性抗生素治疗的快速检测的前景。这种快速检测将为资源有限环境中的患者带来关键获益,包括中低收入国家、大流行和大规模伤亡场景,以及军事行动期间的野战延期救护。未来仍需开展进一步工作,首先是扩大发现数据集以确保所选特征在不同流行病学环境中均表现稳健,其次是在独立的测试集中正式验证该特征。 利益披露 所有作者:无报告的利益披露
Wheelock et al. (Thu,) 研究了这一问题。
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