L'objectif est de profiler simultanément l'accessibilité de la chromatine et la liaison des protéines associées à l'ADN dans des cellules individuelles.
Utilisé la plateforme BGI C4 pour la capture de données
Effectué un ATAC-seq à cellule unique sur la lignée cellulaire K562
Réalisé un CUT&Tag à cellule unique sur des échantillons de cancer du foie
Capturé avec succès des données sur l'accessibilité de la chromatine et la liaison dans des cellules uniques
Identifié des interactions protéiques spécifiques dans les cellules K562 et cancéreuses du foie
Abstract
Ce projet est basé sur la plateforme BGI C4 pour capturer simultanément les données ATAC-seq et CUT&Tag à cellule unique de la lignée cellulaire K562 et d'un échantillon de cancer du foie.