Résumé Les maladies neurodégénératives (ND) posent des défis cliniques en raison de leur complexité et de leur hétérogénéité moléculaire. Ici, nous présentons un atlas pan-néurodégénératif (PanNDA) issu d'une analyse protéomique multilayer et approfondie de 2 279 échantillons de cerveau humain couvrant 6 grandes ND : la maladie d'Alzheimer (AD), la démence à corps de Lewy (LBD), la dégénérescence lobaire frontotemporale avec une pathologie TDP-43, la paralysie supranucléaire progressive avec une pathologie tau, la démence vasculaire et la maladie de Parkinson. PanNDA intègre des données provenant du protéome entier, du protéome insoluble dans les détergents et des modifications post-traductionnelles (phosphorylation et ubiquitination), permettant des comparaisons intra- et inter-maladies. Les analyses intra-maladie révèlent des sous-types moléculaires distincts (par exemple, trois dans l'AD et quatre dans la LBD), mettent en évidence des voies dysrégulées et priorisent les protéines les mieux classées. Les comparaisons inter-maladies identifient des altérations partagées dans les ND, telles que GPNMB dans l'activation microgliale et lysosomale et NPTX2 dans la régulation synaptique, ainsi que des changements spécifiques à la maladie et des régulateurs centraux au sein des réseaux protéiques. Dans l'ensemble, PanNDA fournit un cadre de niveau système pour comprendre les mécanismes des ND et sert de ressource fondamentale accessible via un site web interactif : https://penglab.shinyapps.io/pannda.
Shrestha et al. (Sun,) ont étudié cette question.