مع ظهور تقنيات جديدة لتتبع أنساب الخلايا الأحادية، يتم استخدام أدوات الشجرة التطورية والديناميكية بشكل متزايد لدراسة العمليات التنموية. ومع ذلك، فإن الطرق التقليدية لديناميكا التطور تعتمد على افتراضات يصعب تبريرها في السياقات التنموية. نحن نقدم تعميماً لنموذج ديناميكا التطور المتعلق بالولادة والموت إلى نموذج ديناميكا التطور المعتمد على العمر. تلتقط هذه الطريقة سمة رئيسية في النمو: نظراً لأن الخلايا تتقسم بعد أوقات جيل محددة بدلاً من أوقات الانتظار الأسية، فإن أشجار نسب الخلايا التجريبية تنحرف عن النسب المتولدة تحت نموذج الولادة والموت. من خلال تطبيق طريقتنا على مجموعة بيانات عامة لمستعمرات الخلايا الجذعية، نوضح كيف كانت تقديرات سابقة للمعلمات الديناميكية السكانية متحيزة بسبب اختيار شجرة ولادة وموت مسبقة. كما نعرض طريقتنا على أشجار النسب الجنيني لطرف العنكبوتيات، مما يُظهر أن الاعتماد على العمر يبدو أنه سمة شائعة في النمو. بعيداً عن البيولوجيا التنموية، يوفر إطارنا نهجاً لتحليل الأنظمة التي قد يتم انتهاك افتراضات الولادة والموت التقليدية فيها أو حيث يتم التقاط أشكال الأشجار التجريبية بشكل سيئ من تلك المتوقعة تحت نماذج ديناميكية التطور القياسية. طريقتنا متاحة كحزمة لـ BEAST2.
درس مالبرري وآخرون (الثلاثاء) هذا السؤال.