粪便取样是一种为野生动物遗传学研究获取DNA的无创方法。黑帽卷尾猴(Sapajus nigritus)以及巴西东南部的入侵性狨猴——普通狨(Callithrix jacchus)、黑耳狨(C. penicillata)及其杂交种一直是这些研究的目标。用于从粪便中提取DNA的商业试剂盒成本仍然较高,为应对这一情况,可以使用实验室自配方案。我们的目标是测试 Finger (2015) 和 Doyle & Doyle (1987) 方案提取 S. nigritus 和 Callithrix spp. 粪便DNA的效果,评估其用于PCR的效率以及采集时间和保存方法的影响。在里约热内卢的不同地点和时期共采集了13份粪便样本。设计了三个实验来测试这些方案。在实验1中,使用2015年、2018年和2019年采集并保存在70%乙醇中的样本,两种方案均未获得DNA。对于2023年采集的样本,Finger 方案在实验2和实验3中也未成功。Doyle & Doyle 方案在实验2和实验3中表现出高效性,适用于采集当天提取以及在 -20°C 下储存长达一个月的样本。Callithrix 的粪便DNA在第一次PCR中即产生了扩增产物,而 S. nigritus 仅在第二次PCR中产生(在对DNA进行稀释并可能降低了抑制物浓度之后)。Doyle & Doyle (1987) 方案对于从新鲜粪便或在 -20°C 下储存长达30天的粪便中提取所研究物种的粪便DNA是有效的。
Medeiros et al. (Wed,) 研究了这一问题。