Analyse génomique de la liaison de l'ADAR1 et son implication dans plusieurs voies de traitement de l'ARN

Les adénosine désaminases agissant sur l'ARN (ADAR) sont les principaux facteurs sous-jacents à l'édition de l'adénosine en inosine (A-à-I) chez les métazoaires. Ici, nous rapportons la première étude mondiale de l'interaction ADAR1-ARN dans les cellules humaines utilisant le CLIP-seq. Un grand nombre de sites CLIP sont observés dans les répétitions Alu, en accord avec la fonction d'ADAR1 dans l'édition de l'ARN. Étonnamment, des milliers d'autres sites CLIP sont situés dans des régions non-Alu, révélant des cibles fonctionnelles et biophysiques d'ADAR1 dans la régulation de l'utilisation alternative des 3' UTR et la biogenèse des miARN. Nous observons que la liaison d'ADAR1 aux 3' UTR empêche la liaison par d'autres facteurs, provoquant un allongement des 3' UTR. De même, ADAR1 interagit avec DROSHA et DGCR8 dans le noyau et pourrait même surpasser DGCR8 dans la liaison des miARN primaires, ce qui améliore l'expression des miARN matures. Ces fonctions dépendent de l'activité d'édition d'ADAR1, du moins pour un sous-ensemble de cibles. Notre étude révèle un large éventail des rôles fonctionnels d'ADAR1.