回転がリガンド-タンパク質結合の拡散制御速度に与える影響

かなり大きなリガンド分子がタンパク質に結合する速度は、特定の回転方向の要求によって通常の拡散制御速度よりも低下します。この効果の単純な近似的な扱いが、球状および楕円体のリガンドの特別な場合に対して示されています。楕円体のリガンドの中心がタンパク質表面に近づくと、リガンドの回転が制限されることにより、リガンドと表面の間に有効な反発ポテンシャルが生じます。エイリング速度理論の頻度因子kT/hは、溶液中の拡散を含むこれらの反応でD/Rlambdaに置き換えられます。ここで、Dはリガンドの拡散係数、lambdaはリガンドの熱デブロイ波長、Rはタンパク質の結合部位周辺の「捕獲」距離を表します。