Cinética de molécula única y microcopía de superresolución mediante imágenes de fluorescencia de uniones transitorias en origami de ADN

El origami de ADN es un método poderoso para el ensamblaje programable de estructuras moleculares a escala nanométrica. Para las aplicaciones de estas estructuras como biomateriales funcionales, el estudio de la cinética de reacción y de los procesos dinámicos en tiempo real y con alta resolución espacial se vuelve cada vez más importante. Presentamos un ensayo de molécula única para el estudio de la cinética de unión y desunión en origami de ADN. Encontramos que la cinética de hibridación a extensiones de cadena simple en origami de ADN es similar a la del ADN inmovilizado en sustrato aislado, con una ligera dependencia de la posición en el origami. Sobre la base del conocimiento de la cinética, aprovechamos la unión específica reversible de oligonucleótidos marcados a nanostructuras de ADN para imágenes PAINT (acumulación de puntos para imágenes en topografía a escala nanométrica) con una resolución de <30 nm. El método se demuestra para estructuras de ADN monoméricas planas así como para estructuras de ADN multiméricas en forma de cinta.