Les nodules de pois de senteur abritent des communautés bactériennes non-rhizobiales qui sont façonnées par le type de sol plutôt que par le génotype de la plante

De nombreuses études ont montré une grande diversité de bactéries associées aux nodules racinaires des légumineuses. Bien que la plupart de ces bactéries ne forment pas de nodules avec les légumineuses elles-mêmes, il a été démontré qu'elles peuvent entrer dans des fils d'infection lorsqu'elles sont co-inoculées avec des souches de rhizobium. L'objectif de ce travail était de décrire la diversité des communautés bactériennes associées aux nodules racinaires de pois de senteur (Vigna unguiculata L. Walp) en utilisant le séquençage d'amplicons du gène 16S rRNA, en fonction des facteurs génotype de la plante et type de sol. Comme prévu, Bradyrhizobium était le genre le plus abondant des genres détectés. De plus, nous avons trouvé une grande diversité bactérienne associée aux nodules de pois de senteur ; les unités taxonomiques opérationnelles (OTUs) liées aux genres Enterobacter, Chryseobacterium, Sphingobacterium et aux Enterobacteriaceae non classées étaient les plus abondantes. La présence de ces groupes était significativement influencée par le type de sol et, dans une moindre mesure, par le génotype de la plante. Fait intéressant, les OTUs assignées à Chryseobacterium étaient très abondantes, en particulier dans les échantillons obtenus d'un sol Ultisol. Nous avons confirmé leur présence dans les nodules racinaires et évalué leur diversité en utilisant une approche d'isolement ciblé. Bien que leur rôle fonctionnel doive encore être abordé, nous postulons que les souches de Chryseobacterium pourraient aider la plante de pois de senteur à faire face au stress salin dans les régions semi-arides.