miRTargetLink 2.0—インタラクティブなmiRNAターゲット遺伝子およびターゲット経路ネットワーク

特定のmiRNAによって調節される遺伝子、遺伝子セット、または経路はどれですか？特定の生理学的コンテキストにおいて、どのmiRNAが特定のターゲット遺伝子またはターゲット経路を調節しますか？このような一般的な研究質問に答えることは、時間がかかり、労力を要する場合があります。特に、計算経験のない研究者にとっては、異なるデータソースの統合、適切なパラメータの選択、明確な視覚化が要求されることがあります。包括的な分析は、複雑な生物学的質問に対する適切な回答を提示するための中心的なものであるべきです。miRTargetLink 2.0を使用すると、ヒト、マウス、ラットのmiRNAネットワークのためのオールインワンソリューションを開発します。ユーザーは、単一の遺伝子、遺伝子セット、または遺伝子経路、あるいは単一のmiRNA、miRNAのセット、またはmiRNA経路を一方向の検索モードで入力します。また、遺伝子とmiRNAは双方向の検索モードで共同提供できます。選択されたエンティティに対しては、異なるデータソースから相互作用グラフが生成され、動的に表示されます。ミエAAおよびGeneTrailに対応したアプリケーションプログラミングインターフェース（API）が、経路やコンテキスト注釈付きネットワークノードのカテゴリーの下流分析を促進します。miRTargetLink 2.0は、https://www.ccb.uni-saarland.de/mirtargetlink2で自由にアクセスできます。