TCRD und Pharos 2021: Abbau des menschlichen Proteoms für die Krankheitsbiologie

Im Jahr 2014 starteten die National Institutes of Health (NIH) das Programm Illuminating the Druggable Genome (IDG), um wenig charakterisierte Proteine zu identifizieren und unser Verständnis davon zu verbessern, die potenziell mit kleinen Molekülen oder Biologika moduliert werden können. Zwei Ressourcen, die aus diesen Bemühungen hervorgegangen sind, sind: Die Target Central Resource Database (TCRD) (http://juniper.health.unm.edu/tcrd/) und Pharos (https://pharos.nih.gov/), eine Webschnittstelle zum Durchsuchen der TCRD. Das ultimative Ziel dieser Ressourcen ist es, Forschung zu derzeit wenig untersuchten Proteinen hervorzuheben und zu erleichtern, indem eine Vielzahl von Datenquellen aggregiert und die Ziele basierend auf der verfügbaren Datenmenge eingestuft werden und die Daten in einem maschinenlernfähigen Format präsentiert werden. Seit der Veröffentlichung im Jahr 2017 haben sowohl TCRD als auch Pharos zwei große Veröffentlichungen produziert, die 25 zusätzliche Datenquellen integriert oder erweitert haben. Neu integrierte Datentypen umfassen Protein-Protein-Wechselwirkungen zwischen Mensch und Virus, Protein-Krankheits- und Protein-Phänotyp-Assoziationen sowie durch Medikamente induzierte Gen-Signaturen, unter anderem. Diese aggregierten Daten haben es uns ermöglicht, neue Visualisierungen und Inhaltsabschnitte in Pharos zu erstellen, um Benutzer zu ermächtigen, neue Forschungsbereiche im druckbaren Genom zu finden.