Die Oxidationen von Nukleinsäuren können ubiquitär in Zellen auftreten. Eine solche Oxidation wird durch Singulett-Sauerstoff (1O2) verursacht, der in Zellen produziert wird und oft die ursprüngliche Funktion der Nukleinsäuren verändert. Zuvor haben wir gezeigt, dass 1O2, der durch Photoirradiation von Fotosensibilisatoren, die an den DNA-Duplex gebunden sind, erzeugt wird, radial aus der zylindrischen Oberfläche diffundiert, was zu einer schlechten Photooxidationseffizienz von Guanin führt. In dieser Studie fanden wir heraus, dass die Photooxidation des entsprechenden RNA-Duplex etwa viermal schneller verlief als die des DNA-Duplex. Darüber hinaus untersuchten wir die Photooxidation mit RNA-Duplexen, die unterschiedliche Abstände zwischen Fotosensibilisator und Guanin aufwiesen, sowie einen extern hinzugefügten Fotosensibilisator, die Oxidationshemmung mit NaN3 und Ascorbinsäure sowie den Verbrauch von 1O2 mit Furfurylalkohol während der Photooxidation. Alle hier durchgeführten Studien entsprechen einem Mechanismus, bei dem die Höhlung im Doppelstrang eines fotosensibilisatorgebundenen Antisense-Oligonukleotids und RNA einen Kanal für 1O2 und einen Schutz für den Fotosensibilisator bietet, sodass dieser vor Quenching durch Bulk-H2O geschützt ist, was zu einer effizienten Photooxidation von RNA führt. Die in dieser Studie gewonnenen Ergebnisse werden wertvolle Informationen über die Trajektorie von 1O2 bei der Oxidation von RNAs hinzufügen.
Kanamori et al. (Fr,) haben diese Frage untersucht.