Champuru 是一个基于网络的软件工具,帮助确定在通过同时测序两条不等长的 DNA 模板获得的混合 Sanger 色谱图中存在的两个序列。之前的版本(Champuru 1.0)作为一个简单的 Perl CGI(公共网关接口)应用程序发布,但托管它的服务器已被停用,这促使我们更新 Champuru 并进一步开发。新的 Champuru 2 实现于 Haxe,并托管在 GitHub Pages,提供了改进的图形用户界面以及更复杂的算法来计算比对分数,使检测正向和反向痕迹之间最可能的比对位置更加高效。它还将比对分数的分布与理论期望进行比较,用于比较两条随机序列,并使用此比较计算检测到的偏移对的 p 值。此外,Champuru 2 现在使得分析其他偏移对成为可能,而不仅限于所选算法检测到的最可能的偏移对。Champuru 2 可以在 https://eeg-ebe.github.io/Champuru/ 免费访问,包括图形用户界面(运行从 Haxe 源代码转换来的 JavaScript 版本)和编译的命令行版本(通过将 Haxe 源代码转译为 C++ 获得)。
Spöri 等人(Sun,)研究了这个问题。