Le paysage transcriptionnel du médulloblastome Shh

Le médulloblastome Sonic hedgehog englobe un groupe de cancers cliniquement et moléculairement diversifié du système nerveux central en développement. Ici, nous utilisons le séquençage impartial du transcriptome sur une large cohorte de 250 tumeurs pour révéler des différences parmi les sous-types moléculaires de la maladie et démontrer l'importance jusqu'ici non appréciée des transcrits d'ARN non codants. Nous identifions des altérations au sein de la voie dépendante de l'AMPc (GNAS, PRKAR1A) qui convergent sur l'activité de GLI2 et montrons que 18 % des tumeurs ont un événement génétique qui cible directement l'abondance et/ou la stabilité de MYCN. De plus, nous découvrons un réseau étendu de fusions dans des régions amplifiées de manière focale englobant GLI2, et plusieurs fusions de perte de fonction dans les gènes suppresseurs de tumeurs PTCH1, SUFU et NCOR1. La convergence moléculaire sur un sous-ensemble de gènes par des variants nucléotidiques, des aberrations du nombre de copies et des fusions de gènes souligne les rôles clés de voies spécifiques dans la pathogenèse du médulloblastome Sonic hedgehog et ouvre des opportunités pour une intervention thérapeutique.