Knockdown rapide et réversible des protéines endosomales étiquetées de manière endogène par un dégradateur HaloPROTAC optimisé

d'une déplétion d'environ 95 % à 48 h) de SGK3 étiqueté Halo, bloquant la phosphorylation en aval du substrat SGK3 NDRG1. HaloPROTAC-E a induit de manière plus puissante une dégradation plus importante de l'état d'équilibre de VPS34 endogène étiqueté Halo que le composé HaloPROTAC3 précédemment rapporté. La protéomique quantitative globale a révélé que HaloPROTAC-E est remarquablement sélectif, induisant uniquement la dégradation du complexe VPS34 endogène étiqueté Halo (VPS34, VPS15, Beclin1 et ATG14) et aucune autre protéine n'a été significativement dégradée. Cette étude illustre la combinaison des HaloPROTACs avec le marquage protéique endogène CRISPR/Cas9 comme une méthode utile pour induire une dégradation rapide et réversible des protéines endogènes afin d'interroger leur fonction.