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Die vorliegende Übersicht befasst sich mit einer Reihe von Präfraktionierungsprotokollen zur Vorbereitung der zweidimensionalen Kartenanalyse, sowohl im Bereich der Chromatographie als auch im Bereich der Elektrophorese. Im ersten Fall hat die Gruppe von Fountoulaki nahezu jedes chromatographische Verfahren berichtet, das als Präfraktionierungsschritt nützlich ist, einschließlich Affinitäts-, Ionenaustausch- und umgekehrten Phasenharzen. Aufgrund der verschiedenen Anreicherungsstufen konnten mehrere hundert neue Arten, die zuvor in nicht fraktionierten Proben nicht nachgewiesen wurden, erstmals entdeckt werden. Elektrophoretische Präfraktionierungsprotokolle umfassen alle elektrokinetischen Methoden, die in freier Lösung durchgeführt werden, wobei im Wesentlichen alle auf isoelektrischer Fokussierung basieren. Die hier überprüften Geräte umfassen Mehrkammerapparate, wie den Multikompartment-Elektrolyseur mit Immobiline-Membranen, Off-Gel-Elektrophorese in einem Multitassen-Gerät und das Rotofor, ein Instrument, das ebenfalls auf einem Mehrkammer-System basiert, aber die konventionelle Technik des Träger-Ampholyt-Fokussierens nutzt. Weitere interessante Instrumente sind der Octopus, ein Durchflussgerät zur isoelektrischen Fokussierung in einem aufwärts fließenden Flüssigkeitsvorhang, und der Gradiflow, bei dem verschiedene pI-Schnitte durch einen mehrstufigen Durchgang durch zwei Kompartimente mit unterschiedlichen pH-Werten erhalten werden. Es wird angenommen, dass diese Vielzahl von Methoden einen starken Schritt nach vorne bieten könnte, um "unter dem Eisbergspitzen zu graben" und das "nicht gesehene Proteom" zu erkennen.
Righetti et al. (Fri,) haben diese Frage untersucht.