酵母サッカロマイセス・セレビシエのRNAポリメラーゼIII装置の全ゲノム占有プロファイルは、転写複合体が不完全な遺伝子座を明らかにする

クロマチン免疫沈降法を用い、その後マイクロアレイハイブリダイゼーションを行い、酵母サッカロマイセス・セレビシエにおけるRNAポリメラーゼ（Pol）III転写装置の全ゲノム分布を決定しました。Pol IIIトランスクリプトームには、すべてのtRNA遺伝子、以前に特定された非tRNA Pol III遺伝子、および小核RNAをコードするSNR52が含まれています。予想外にも、TFIIICによって占有されている8つのETC遺伝子座を特定しましたが、他のPol III機構の成分には占有されていません。いくつかのETC遺伝子座には、密接に関連する酵母種間で高度に保存されたDNAの伸びが含まれており、これらが機能的RNAをコードする可能性が示唆されます。ETC6はTFIIICのタウ91サブユニットをコードする遺伝子の上流に位置しており、重要なPol III因子のPol III調節発現の可能性を示唆しています。また、すべてのPol III機構の成分によって結合されているZOD1遺伝子座も特定しましたが、密接に関連する酵母種間で保存されたRNAを発現しているようには見えません。ZOD1およびETC遺伝子座のBブロックモチーフといくつかの隣接ヌクレオチドは非常に類似しており、酵母種間で高度に保存されています。さらに、ZOD1およびETC遺伝子座に対するPol III因子の結合の異常なプロファイルは、異なるサッカロマイセス種においても完全に保存されており、これらの遺伝子座が新しい機能的エンティティを表していることを示しています。