Validation multicentrique d'un profil d'expression génique de 1 550 gènes pour l'identification du tissu d'origine de la tumeur

OBJECTIF : Les malignités trouvées dans des emplacements inattendus ou avec des morphologies peu différenciées peuvent poser un défi significatif pour la détermination du tissu d'origine. Les techniques histologiques et d'imagerie actuelles ne permettent pas d'identifier de manière définitive le tissu d'origine dans un nombre significatif de cas. L'objectif de cette étude était de valider un profil d'expression génique prédéfini de 1 550 gènes à cette fin. MÉTHODES : Quatre institutions ont traité 547 spécimens congelés représentant 15 tissus d'origine à l'aide de microarrays d'oligonucléotides. La moitié des spécimens était des tumeurs métastatiques, le reste étant des cancers primitifs peu différenciés et indifférenciés choisis pour ressembler à ceux qui présentent un défi clinique. RÉSULTATS : Dans cette étude de validation multicentrique en aveugle, le profil d'expression génique de 1 550 gènes s'est révélé très informatif dans la détermination des tissus. L'étude a trouvé une sensibilité globale (pourcentage d'accord positif avec le diagnostic de référence) de 87,8 % (IC à 95 %, 84,7 % à 90,4 %) et une spécificité globale (pourcentage d'accord négatif avec le diagnostic de référence) de 99,4 % (IC à 95 %, 98,3 % à 99,9 %). La performance au sein du sous-groupe de tumeurs métastatiques (n = 258) était légèrement inférieure à celle du sous-groupe des tumeurs primitives peu différenciées et indifférenciées, respectivement de 84,5 % et 90,7 % (P = .04). Les différences entre les laboratoires individuels n'étaient pas significatives sur le plan statistique. CONCLUSION : Cette étude représente la première validation multicentrique de taille adéquate d'un profil d'expression génique pour la détermination du tissu d'origine restreint aux cancers primitifs peu différenciés et indifférenciés ainsi qu'aux tumeurs métastatiques. Ces résultats indiquent que ce profil devrait être un ajout précieux ou une alternative aux méthodes de diagnostic actuellement disponibles pour l'évaluation des cancers primitifs incertains.