Molekulare Charakterisierung und geografische Verteilung des Zika-Virus weltweit von 1947 bis 2022

ZIELSETZUNGEN: Wir führten eine molekulare Charakterisierung durch, demonstrierten die geografische Verteilung des Zika-Virus (ZIKV), das von 1947 bis 2022 weltweit zirkulierte, und untersuchten die potenzielle genetische Rekombinationsstelle in den ZIKV-Genomen aus Thailand. METHODEN: Wir konstruierten phylogenetische Bäume basierend auf ZIKV-codierenden Sequenzen (CDS) und bestimmten die geografische Verteilung der repräsentativen Viren anhand genetischer Beziehungen und Zeitachse. Wir bestimmten genetische Rekombinationen unter ZIKV und zwischen ZIKV und anderen Flaviviren mithilfe von Ähnlichkeitsdiagrammen und Boots-Analysen, zusammen mit der Phylogenie, die die CDS und acht subgenomische Regionen umfasste. ERGEBNISSE: Die phylogenetischen Bäume, die 717 CDS umfassten, zeigten zwei unterschiedliche afrikanische und asiatische Linien. ZIKV in der afrikanischen Linie bildete zwei Sub-Linien, und ZIKV in der asiatischen Linie diversifizierte sich in die asiatischen und amerikanischen Sub-Linien. Der malaysische Isolat von 1966 wurde als Prototyp der asiatischen Sub-Linie bezeichnet und bildete einen Knoten mit nur einem Mitglied, während die neueren Viren einen ausgeprägten Knoten bildeten. Wir beobachteten keine genetische Rekombination im ZIKV aus Thailand. FAZIT: Fünf in Thailand entdeckte Isolate aus dem Jahr 2006 waren die zweitältesten ZIKV nach dem malaysischen Prototyp. Unser Ergebnis deutete auf zwei unabhängige Routen der ZIKV-Ausbreitung von Südostasien nach Mikronesien im Jahr 2007 und Französisch-Polynesien im Jahr 2013 hin, bevor es weiter in südamerikanische Länder verbreitete.