Beurteilung der genetischen Vielfalt von Wasserstoffcyanid, Gesamtkarotinoidgehalt und Trockensubstanzgehalt in bioangereichertem Maniok unter Verwendung von merkmalverknüpften SNP-Markern

Die Beurteilung der genetischen Vielfalt ist entscheidend für die Identifizierung nützlicher Allele zur Verbesserung von Kulturpflanzen. Diese Studie bewertete die genetische Vielfalt zwischen zwei Maniok-Züchtungspopulationen hinsichtlich des Gesamtkarotinoidgehalts (TCC), des Trockensubstanzgehalts (DMC) und der Wasserstoffcyanid (HCN)-Konzentration unter Verwendung von merkmalverknüpften einzelnen Nukleotidpolymorphismen (SNP)-Markern. Insgesamt wurden 360 Genotypen analysiert, darunter 261 aus dem IITA-Züchtungsprogramm (Population 1), 23 Urahnlinien und 76 aus dem Züchtungsprogramm der Universität von Ibadan Cassava (UIC) (Population 2). Die Häufigkeit des minor Allels (MAF), die Genvielfalt (GD), die beobachtete Heterozygotie (He) und der polymorphe Informationsgehalt (PIC) wurden berechnet. Eine Hauptkomponentenanalysen (PCA) und hierarchische Clusteranalysen wurden durchgeführt, um die genetische Variation und Struktur der Population zu untersuchen. Die Anrufquoten lagen hoch (96–100%). MAF reichte von 0,00 bis 0,50, mit Mittelwerten von 0,28, 0,28 und 0,29 für Population 1, Population 2 und Urahnen. GD betrug im Durchschnitt 0,36, 0,36 und 0,35 für diese Gruppen. Die beobachtete Heterozygotie betrug 0,42, 0,41 und 0,43, während die PIC-Werte im Durchschnitt 0,29, 0,27 und 0,27 für Population 1, Population 2 und Urahnen betrugen. PCA und Clusteranalysen gruppierten die Genotypen in drei Cluster mit 257, 88 und 15 Genotypen. Die ersten beiden Hauptkomponenten erklärten 39,1 % der gesamten genetischen Variation. Die Ergebnisse deuten auf eine erhebliche genetische Vielfalt unter den untersuchten Genotypen hin, was auf ein starkes Potenzial für Allelpyramiding hindeutet und die Informativität der verwendeten SNP-Markern hervorhebt.