ブートストラッピングクラスター分析：マイクロアレイ実験からの結論の信頼性の評価

遺伝子発現マイクロアレイデータに適用されるクラスタリングツールから統計的推論を行うための一般的な手法を紹介します。このアプローチは、複数の条件における遺伝子の差次的発現を推定し、正規化を達成するために分散分析モデルを利用します。統計的推論は、ブートストラッピングというランダム化手法の適用に基づいています。ブートストラッピングは、個々の遺伝子の差次的発現の推定値に対する信頼区間を取得するために以前に使用されてきました。ここでは、クラスタ分析からの結果の安定性を評価するためにブートストラッピングを適用します。公開されているデータセットを用いて手法を示し、データの変動に照らしてクラスタリング結果の信頼性に関する結論を導きます。ブートストラッピング手続きは実験の複製に依存します。マイクロアレイ実験における複製と良好な設計の意味について議論します。