Escherichia coli आंतरिक झिल्ली प्रोटियोम का वैश्विक टॉपोलॉजी विश्लेषण

कोशिका की झिल्ली का प्रोटीन पूरक मानक प्रोटियॉमिक विश्लेषण और संरचनात्मक अध्ययन के प्रति प्रसिद्ध रूप से प्रतिरोधी है। इसके परिणामस्वरूप, झिल्ली प्रोटियोम अच्छी तरह से परिभाषित नहीं हैं। यहां, हम Escherichia coli आंतरिक झिल्ली प्रोटियोम का वैश्विक टॉपोलॉजी विश्लेषण प्रस्तुत करते हैं। अल्कलाइन फॉस्फेटेज और हरी फ्लोरोसेंट प्रोटीन के साथ C-टर्मिनल टैगिंग का उपयोग करते हुए, हमने 601 आंतरिक झिल्ली प्रोटीन के लिए C टर्मिनल के पेरिप्लाज्मिक या साइटोप्लाज्मिक स्थान स्थापित किए। इस डेटा के साथ एक टॉपोलॉजी भविष्यवाणी एल्गोरिदम को प्रतिबंधित करके, हमने 601 प्रोटीन के लिए उच्च गुणवत्ता वाले टॉपोलॉजी मॉडल तैयार किए, जो इस और अन्य झिल्ली प्रोटियोम के भविष्य के कार्यात्मक अध्ययन के लिए एक मजबूत आधार प्रदान करते हैं। हमने 397 हरी फ्लोरोसेंट प्रोटीन फ्यूज़ के लिए ओवरएक्सप्रेशन क्षमता का भी अनुमान लगाया; परिणाम बताते हैं कि सभी आंतरिक झिल्ली प्रोटीन का एक बड़ा हिस्सा जैव रासायनिक और संरचनात्मक कार्यों के लिए पर्याप्त मात्रा में उत्पन्न किया जा सकता है।