Graphbasierte Methoden zur Analyse von Netzwerken in der Zellbiologie

Die Verfügbarkeit von groß angelegten experimentellen Daten für die Zellbiologie ermöglicht es computergestützten Methoden, das Verhalten zellulärer Netzwerke systematisch zu modellieren. Diese Übersicht betrachtet die neuesten Fortschritte im Bereich der graphengesteuerten Methoden zur Analyse komplexer zellulärer Netzwerke. Die Methoden werden auf drei Ebenen zunehmender Komplexität skizziert, die von Methoden reichen, die globale oder lokale strukturelle Eigenschaften von Netzwerken charakterisieren können, bis zu Methoden, die Gruppen von miteinander verbundenen Knoten erkennen können, die als Motive oder Cluster bezeichnet werden und möglicherweise an gemeinsamen elementaren biologischen Funktionen beteiligt sind. Wir fassen auch kurz neuere Ansätze zur Datenintegration und Netzwerkerschließung mittels graphenbasierter Formalismen zusammen. Schließlich heben wir einige Herausforderungen in diesem Bereich hervor und bieten unsere persönliche Sicht auf die wichtigsten zukünftigen Trends und Entwicklungen in der graphenbasierten Analyse groß angelegter Datensätze.