RNase E와 RNase III는 소규모 조절 RNA RyhB에 의해 번역 억제가 발생할 때 sodB mRNA의 안정성을 조절합니다.

이전 연구에서는 철에 의존하는 sodB mRNA의 정상 상태 농도와 번역 가능성의 변동이 소규모 조절 RNA RyhB, RNA 샤페론 Hfq 및 RNase E에 의해 조절된다는 것을 보여주었습니다. RNase E의 제안된 역할과 일치하게, 우리는 in vivo에서 RNase E의 비활성화 시 sodB mRNA의 분해가 지연된다는 것을 발견했으며, 이 효소가 in vitro에서 sodB 5'-비번역 영역 (5'-UTR) 내에서 절단하여 Hfq 및 리보솜 결합을 촉진하는 5' 줄기 루프 구조를 제거합니다. 또한, RNase E 절단은 sodB 5'-UTR/RyhB 기저 쌍 형성이 발생할 때 사용할 수 있는 암호화된 위치에서 발생할 수 있습니다. 우리는 RyhB가 sodB mRNA와 상호작용하는 데 중요한 역할을 하는 동안 Hfq는 RyhB-sodB mRNA 복합체에 tightly 유지되지 않으며, trans에서 추가된 다른 RNA와의 상호작용을 통해 복합체에서 방출될 수 있음을 보여줍니다. sodB mRNA의 턴오버와는 달리, in vivo에서 RyhB 분해는 주로 RNase III에 의존하며, sodB 5'-UTR와의 기저 쌍 형성시 RNase III에 의한 절단이 촉진됩니다. 이러한 데이터는 sodB mRNA 턴오버에서 RNase E와 RNase III의 관찰된 역할을 설명하는 모델 관점에서 논의됩니다.