ADN satellite centromérique : variation de séquence cachée dans la population humaine

L'objectif central de la génomique médicale est de comprendre la base héréditaire de la variation de séquence qui sous-tend la physiologie humaine, l'évolution et la maladie. Les études d'association fonctionnelle ignorent actuellement des millions de bases qui couvrent chaque région centromérique et le bras court acrocentrique. Ces régions sont enrichies en longues séries de répétitions en tandem, ou ADN satellites, qui varient largement en nombre de copies et en structure de répétition dans la population humaine. La variation de séquence satellite dans le génome humain est souvent si importante qu'elle est détectée cytogénétiquement, mais en raison du manque d'un assemblage de référence et d'outils d'informatique pour mesurer cette variabilité, les études contemporaines d'association à des maladies à haute résolution ne sont pas en mesure de détecter des variants causaux dans ces régions. Néanmoins, les associations récemment découvertes entre la variation de l'ADN satellite et la maladie humaine soutiennent que ces régions représentent une fraction substantielle et biologiquement importante de la variation de séquence humaine. Par conséquent, il est urgent et nécessaire de détecter et d'incorporer cette variation de séquence non caractérisée dans de vastes études sur l'évolution humaine et la génomique médicale. Ici, je discute des connaissances actuelles sur la variation de l'ADN satellite dans le génome humain, en me concentrant sur les satellites centromériques et leurs implications potentielles pour la maladie.