Extraction d'information en biologie moléculaire

L'extraction d'information est devenue un domaine très actif en bioinformatique récemment et un certain nombre d'articles intéressants ont été publiés. La plupart des efforts ont été concentrés sur quelques problèmes spécifiques, tels que la détection des interactions protéine-protéine et l'analyse des matrices d'expression de l'ADN, bien qu'il soit évident qu'il existe de nombreuses autres zones d'application potentielle intéressantes (récupération de documents, description fonctionnelle des protéines, et détection de gènes liés aux maladies pour n'en nommer que quelques-uns). Paradoxalement, ces développements passionnants n'ont pas encore cristallisé en un accord général sur un ensemble de critères d'évaluation standards, comme ceux développés dans des domaines tels que la prédiction de structure protéique, ce qui rend très difficile la comparaison des performances entre ces différents systèmes. Dans cette revue, nous introduisons le domaine général de l'extraction d'information, nous décrivons l'état des applications en biologie moléculaire, et nous discutons ensuite de quelques idées sur les normes possibles pour l'évaluation qui sont nécessaires pour le développement futur du domaine.