Key points are not available for this paper at this time.
تقدم هذه المقالة نتائج التنبؤات العمياء المقدمة لتجربة توقع بنية البروتين CASP4. قمنا بعمل مجموعتين من التنبؤات: واحدة باستخدام الخادم الآلي بالكامل SAM-T99 وأخرى باستخدام الطريقة المحسنة SAM-T2K مع تدخل بشري. تستخدم كلتا الطريقتين طرق نموذج ماركوف الخفي التكرارية لبناء ملفات تعريف عائلات البروتين، باستخدام معلومات التسلسل فقط. على الرغم من أن طريقة SAM-T99 قائمة بالكامل على التسلسل، إلا أن طريقة SAM-T2K تستخدم الهيكل الثانوي المتوقع للتسلسل المستهدف والهيكل الثانوي المعروف للقوالب لتحسين التعرف على الطية والمحاذاة. في هذه المقالة، نحاول تحديد الجوانب التي أدت إلى الأداء الأفضل بشكل ملحوظ لطريقة SAM-T2K في تجربة CASP4 على أمل إنتاج خادم توقع تلقائي أفضل. يبدو أن استخدام التنبؤ بالهيكل الثانوي هو التحسين الفردي الأكثر قيمة، على الرغم من أن المجموع الكلي للتدخلات البشرية المختلفة قد يكون على الأقل بنفس الأهمية.
دراسة كاربلوس وآخرون (Mon,) هذا السؤال.