蛋白质序列中三维结构模式的轮廓扫描

轮廓分析测量目标序列与一组对齐序列（探针）之间的相似性。探针序列用于生成位置特异性评分表（轮廓），可使用标准动态编程方法与任何序列（目标）对齐。我们正在开发一个轮廓库，每个轮廓描述不同的结构基元。这允许快速扫描任何目标序列，以探测结构基元。在与轮廓比较目标序列时，先前确定了显著性水平，从而允许客观判断蛋白质是否可能具有结构基元。