Eine einzigartige Struktur am Carboxylterminus der größten Untereinheit der eukaryotischen RNA-Polymerase II.

Die gereinigte eukaryotische nukleare RNA-Polymerase II besteht aus drei Subtypen, die sich in den scheinbaren Molekulargewichten ihrer größten Untereinheit unterscheiden, die für die Polymerasespezies IIO, IIA und IIB mit IIo, IIa und IIb bezeichnet werden. Die Untereinheiten IIo, IIa und IIb sind Produkte eines einzigen Gens. Hier präsentieren wir die Aminosäurezusammensetzung der Rinderthymus-Untereinheiten IIa und IIb sowie die C-terminale Aminosäuresequenz der Untereinheit IIa (IIo), die aus der Nukleotidsequenz eines Teils des Mausgens abgeleitet wurde, das diese RNA-Polymerase-Untereinheit kodiert. Die berechnete Aminosäurezusammensetzung des Peptids, das für die Untereinheit IIa einzigartig ist, zeigt, dass die Untereinheit IIa eine domänenreiche Struktur enthält, die reich an Serin, Prolin, Threonin und Tyrosin ist. Die Sequenz am 3'-Ende des Mausgens für die größte Untereinheit der RNA-Polymerase II zeigt, dass die C-terminale Domäne aus 52 Wiederholungen eines sieben Aminosäuren langen Blocks mit der Konsenssequenz Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser besteht. Diese Sequenz ist auch insofern ungewöhnlich, als sie einen hohen Prozentsatz an potenziellen Phosphorylierungsstellen enthält.