RNAiDB和PhenoBlast：基因组范围表型绘图项目的网络工具

RNA干扰（RNAi）正被用于大规模基因组研究，作为获取与特定基因相关的体内功能信息的快速方法。如何最佳地存档和挖掘这些研究中派生的复杂数据，针对用于引发RNAi反应的方法和收集的功能数据，提出了一系列挑战。RNAiDB（RNAi数据库；http://www.rnai.org）被创建用于存档、分发和分析来自大规模RNAi分析的秀丽隐杆线虫的表型数据。该数据库包含一个公共数据汇编，并提供关于实验方法和表型结果的信息，包括以图像和流式延时影片形式呈现的原始数据。表型摘要以及RNAi与基因映射的图形展示允许快速直观地比较不同RNAi实验的结果，并基于多序列分析方法可视化每个RNAi实验可能抑制的基因产物。RNAiDB可以通过组合查询进行搜索，并且使用新工具PhenoBlast，该工具根据总体表型相似性对基因进行排序。RNAiDB可以作为一个模型数据库，用于分发和导航来自不同生物的大规模系统性表型分析的体内功能信息.