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L'intestin grêle humain contient une microbiote, dont les composants sont globalement complexes et métaboliquement divers. Sa fonction principale est de récupérer de l'énergie à partir des glucides non digérés dans l'intestin supérieur. Cela se fait par fermentation et absorption des principaux produits, les acides gras à chaîne courte (AGCC), qui représentent 40-50 % de l'énergie disponible des glucides. Les principaux AGCC, acétate, propionate et butyrate, sont métabolisés par l'épithélium colique (butyrate), le foie (propionate) et les muscles (acétate). Les bactéries intestinales jouent également un rôle dans la synthèse des vitamines B et K et le métabolisme des acides biliaires, d'autres stérols et des xénobiotiques. La microflore colique est également réactive à l'alimentation. En présence de substrats glucidiques fermentescibles tels que les polysaccharides non amylacés, l'amidon résistant et les oligosaccharides, les bactéries se multiplient et synthétisent activement des protéines. La quantité de synthèse et de renouvellement des protéines dans le gros intestin est difficile à déterminer, mais environ 15 g de biomasse sont excrétés dans les fèces chaque jour, contenant 1 g d'azote bactérien. Il reste incertain si les acides aminés synthétisés par les bactéries sont jamais absorbés du côlon. Enfin, des micro-organismes coliques individuels tels que les bactéries réductrices de sulfate, les bifidobactéries et les clostridies réagissent sélectivement à des composants diététiques spécifiques d'une manière qui peut être importante pour la santé.
Cummings et al. (Sat,) ont étudié cette question.
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