利用竞争性内源 RNA 网络鉴定与急性淋巴细胞白血病进展相关的 lncRNA

急性淋巴细胞白血病（ALL）是一种骨髓淋巴前体细胞恶性肿瘤。尽管已有有效治疗方法，但其进展或复发的原因仍不明确。寻找预后生物标志物对于早期诊断和更有效的治疗至关重要。本研究旨在通过构建竞争性内源 RNA（ceRNA）网络，鉴定参与 ALL 进展的长链非编码 RNA（lncRNA）。这些 lncRNA 可能作为 ALL 发生发展中的潜在新生物标志物。GSE67684 数据集鉴定了参与 ALL 进展的 lncRNA 和 mRNA 变化。对本研究的数据进行了重新分析，并检索了与 lncRNA 相关的探针。利用 Targetscan、miRTarBase 和 miRcode 数据库鉴定了与所发现基因和 lncRNA 相关的 microRNA（miRNA）。构建了 ceRNA 网络并筛选了候选 lncRNA。最后，通过反转录定量实时 PCR（RT-qPCR）对结果进行了验证。ceRNA 网络结果表明，与 ALL 中改变的 mRNA 相关的排名靠前的 lncRNA 为 IRF1-AS1、MCM3AP-AS1、TRAF3IP2-AS1、HOTAIRM1、CRNDE 和 TUG1。对与 MCM3AP-AS1、TRAF3IP2-AS1 和 IRF1-AS1 相关的子网络研究表明，这些 lncRNA 与炎症、转移和增殖相关通路显著相关。与对照组相比，在 ALL 样本中发现 IRF1-AS1、MCM3AP-AS1、TRAF3IP2-AS1、CRNDE 和 TUG1 的表达水平更高。MCM3AP-AS1、TRAF3IP2-AS1 和 IRF1-AS1 的表达在 ALL 进展过程中显著升高，发挥致癌作用。由于 lncRNA 在主要癌症通路中发挥作用，它们可能是 ALL 中合适的治疗和诊断靶点。