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土壤微生物组在林业生态系统的养分循环和生态系统稳定性中发挥着核心作用。在此,我们对巴西两个不同生态区域桉树人工林的根际细菌群落进行了探索性分析。使用 16S rRNA 扩增子测序以及随后的 ASV 推断和系统发育重建,我们观察到样本间存在明显的分类组成模式。两个样本中的优势门均为 Actinomycetota、Pseudomonadota、Acidobacteriota 和 Bacillota,其中 Actinomycetota 在 TL(44.0%)中比在 ES(26.5%)中更丰富,而 Acidobacteriota 和 Verrucomicrobiota 在 ES 中丰度更高。Streptomycetaceae 科和 Streptantibioticus 属在 ES 中显著富集(分别为 19.6% 和 18.6%),而 Solirubrobacteraceae、Pseudonocardiaceae 和 Nocardiaceae 则主要与 TL 相关。Eldorado do Sul(ES)样本的特征是具有更高的观测丰富度和系统发育多样性,而 Três Lagoas(TL)样本则表现出相对更高的群落均匀度。Beta 多样性指标与样本间高度的组成差异一致,仅有有限比例的 ASV 构成共享的核心微生物组。尽管存在这种分类学差异,但基于 PICRUSt2 的预测表明各样本间具有一组广泛保守的优势代谢途径。预测的 MetaCyc 途径主要与中心碳代谢、氨基酸生物合成和能量生成相关。与此同时,在样本间也观察到了预测代谢谱的差异。ES 样本表现出与几丁质降解、嘌呤代谢和硝化菌反硝化作用相关途径更高的相对占比,而 TL 样本则表现出与替代 TCA 变体、乙醛酸代谢、甲基萘醌醇生物合成和芳香族化合物降解相关途径更高的相对占比。总体而言,该探索性分析表明,在差异显著的桉树人工林系统中,实质性的分类学变异可能与相对保守的预测功能框架共存。这些观察结果应被视为具有假设生成性质,并突显了未来研究结合重复采样和直接功能测定的必要性。
Cortivo et al. (Sat,) 研究了这一问题。