利用下一代测序技术对植物小RNA进行生物信息学分析

下一代测序技术对广泛的生物学应用产生了重大影响。与许多其他课题组一样，我们利用这些新技术，尤其是 SBS（Sequence-By-Synthesis），对植物中的小 RNA 分子进行深度分析。小 RNA 长度为 21-24 个核苷酸，已知在 mRNA 和基因组 DNA 的激活中发挥重要作用。我们构建了许多 SBS 小 RNA 文库；每个文库可包含超过 300 万个长度大于 33 个核苷酸的特征序列。在此，我们描述了处理这些下一代测序技术产生的大量小 RNA 数据所面临的挑战以及我们的策略。