iLoc-Gpos: مصنف متعدد الطبقات لتوقع الموقع الخلوي الفرعي لبروتينات البكتيريا إيجابية الغرام أحادية الموقع ومتعددة المواقع

من خلال إدخال "مقياس متعدد الطبقات"، بالإضافة إلى دمج معلومات علم جينات الأونطولوجيا ومعلومات التطور المتسلسلة، تم تطوير موضح جديد، يسمى iLoc-Gpos، لتوقع الموقع الخلوي الفرعي لبروتينات البكتيريا إيجابية الغرام ذات مواقع أحادية ومتعددة. لتسهيل المقارنة، تم اعتماد نفس مجموعة البيانات المعقدة المستخدمة لتقدير دقة Gpos-mPLoc لإظهار قوة iLoc-Gpos. تحتوي مجموعة البيانات على 519 بروتينًا من البكتيريا إيجابية الغرام مصنفة إلى المواقع الخلوية الفرعية الأربعة التالية: (1) غشاء الخلية، (2) جدار الخلية، (3) السيتوبلازم، و(4) extracellular؛ ولا يحتوي أي من البروتينات المدرجة على ≥ 25% من هوية التسلسل المقارنة لأي بروتين آخر في نفس المجموعة الفرعية (الموقع الخلوي الفرعي). كانت نسبة النجاح الكلية من خلال اختبار jackknife على مجموعة البيانات المعقدة بهذه الشدة بواسطة iLoc-Gpos أكثر من 93%، أي حوالي 11% أعلى من ذلك بواسطة Gpos-mPLoc. كخدمة ويب سهلة الاستخدام، يمكن الوصول إلى iLoc-Gpos مجانًا للجمهور على http://icpr.jci.edu.cn/bioinfo/iLoc-Gpos أو http://www.jci-bioinfo.cn/iLoc-Gpos. في الوقت نفسه، يتوفر دليل خطوة بخطوة حول كيفية استخدام خدمة الويب للحصول على النتائج المرجوة. علاوة على ذلك، لراحة المستخدم، تحتوي خدمة الويب iLoc-Gpos أيضًا على وظيفة لقبول تقديم الوظائف الدفعة، والتي لا تتوفر في النسخة الحالية من خدمة الويب Gpos-mPLoc.