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SARS-CoV-2刺突蛋白的功能适应性和构象可塑性使其能够有效调节对宿主受体和抗体的复杂表型反应。在本研究中，我们结合原子模拟和基于突变及扰动的扫描方法，研究SARS-CoV-2刺突蛋白与三种不同类别抗体的结合机制。基于集合的SARS-CoV-2刺突蛋白残基的结合和别构倾向的剖析表明，这些蛋白可以作为功能适应性和别构调节的机器。构象动态分析表明，结合引起的软模式调制可以激发对不同类别抗体的独特蛋白反应。突变扫描热图和敏感性分析揭示了与实验深度突变一致的不同类别抗体的结合能热点，显示受全球循环变异体影响的刺突位点K417、E484和N501的结合亲和力差异相对较小，可能无法完全解释观察到的抗体耐药效应。通过对未结合形式和抗体结合形式的SARS-CoV-2刺突蛋白残基进行功能动态分析和扰动响应扫描，我们探讨抗体结合如何调节刺突蛋白残基的别构倾向，并确定控制信号传递和全球构象变化的别构热点。这些结果表明，被循环突变靶向的残基K417、E484和N501对应于一组多功能别构中心，其中小的扰动可以调节集体运动，改变全球别构响应，并引发结合抗性。我们建议SARS-CoV-2 S蛋白可能利用特定别构热点的可塑性生成逃逸突变体，从而改变对抗体结合的反应，而不影响刺突蛋白的活性.
Verkhivker等人（周四）研究了这个问题.