栽培花生的单一杂交起源

本研究是三部分系列中的第一部分，为理解花生作物（Arachis hypogaea）的起源奠定基础。其后续演化将在接下来的两篇论文中探讨。已有十分强有力的证据表明，A. hypogaea 起源于1万年前 Arachis duranensis 和 Arachis ipaënsis 之间的一次杂交事件。在此，我们利用超过1600个单核苷酸多态性扩展了这一证据，对ex situ 保存的野生 Arachis 属基因库与不同序列的栽培花生的 A 和 B 亚基因组进行几乎详尽的比较。花生的野生亲缘种高度自交，其地理果实生长方式允许它们播种自己的种子，使得它们能够在数千年内作为独立种群存在。这种不寻常的生物学提供了一个进行遗传考古的罕见机会：可以以极高的精确度识别祖先谱系。我们的结果重申了栽培种的单一起源，确认 Río Seco 的 A. duranensis 和 A. ipaënsis K 30076 是花生 A 和 B 亚基因组的已知最近亲缘种。作为基因组资源，我们生成了 Río Seco A. duranensis K 30065 的染色体规模组装，并确认它与花生的 A 亚基因组的关系比当前参考基因组（V14167）更为密切。即使通过新的田野采集发现更接近的野生样本，它们仍将属于同一祖先谱系。凭借这一证据级别，花生的起源现在比任何其他古老多倍体作物的起源了解得更为详细。