组学时代的代谢工程：阐明和调节调控网络

在代谢过程中的调控控制的重要性得到了广泛承认，目前正对代谢层次结构各级别的调节机制进行多个（本地和全球的）研究。丰富的生物信息使我们能够识别生物系统的各个组成部分（基因、蛋白质和代谢物），我们现在可以理解这些组成部分之间的相互作用。由于表型是这些相互作用的净结果，因此阐明它们对于理解生理学的整体提升和将生物系统作为细胞工厂的实际应用至关重要。我们展示了一些近期的“-组学”方法，这些方法扩展了我们对基因、蛋白质和代谢物水平调控的理解，随后分析了这一进展对代谢工程发展的影响。尽管本综述并非详尽无遗，但我们努力传达我们的理念，即整合来自代谢层次结构各级别的全球信息对于理解和预测基因表达变化与 resulting phenotype 之间的关系至关重要。本综述的最终目标是为代谢工程师提供关于基因、蛋白质和代谢物水平调控的互补方面的最新进展概述，以及对从事基础研究的人员在将其发现应用于实际应用过程中的潜在障碍的分析。